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Covid-19 : dans la Loire, les chiffres de l’épidémie atteignent des taux record

par Bertrand Enjalbal et Colin Revault.
Publié le 29 octobre 2020.
Imprimé le 29 mars 2023 à 08:12
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[Graphiques] La Loire et la métropole de Saint-Etienne sont parmi les territoires les plus touchés par l’épidémie de Covid-19. A l’échelle de la région comme de celle du pays. La dynamique de l’épidémie continue de progresser à un rythme élevé et se ressent sur les indicateurs hospitaliers. Visualiser les indicateurs en graphiques.

Point hebdomadaire effectué en date du 27 octobre 2020. Voir ici le dernier point régional

En un mois environ, le taux d’incidence dans la Loire a bondi. Entre le 22 septembre et le 20 octobre, il a augmenté de près de 81%. Après une augmentation nette mais relativement modérée durant le mois de septembre, il a explosé au cours du mois d’octobre, doublant quasiment chaque semaine.

L’indicateur, qui participe de la mesure de la dynamique de l’épidémie, affichait au 20 octobre 803 cas pour 100 000 habitants sur une semaine.

Covid-19 : un taux d’incidence record chez les 20-40 ans dans la Loire

Exception faite des plus de 90 ans, où l’apparition de clusters dans des maisons de retraite notamment fait rapidement bondir les chiffres, les 20-40 ans sont les plus touchés dans la Loire. Au sein de ces tranches d’âge, le taux d’incidence dépasse les 1000 cas pour 100 000 habitants.

Chez les 40-60 ans, le taux d’incidence avoisinait également les 1000 cas au 20 octobre.

Au-delà de 60 ans, le taux d’incidence est plus faible mais approche les 680 cas en moyenne pour 100 000 habitants (le seuil d’alerte a été fixé à 50 cas/100 000 habitants, pour rappel).

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Parallèlement, le taux de positivité – autre indicateur de la dynamique de l’épidémie- continue de progresser. Il reste plus de deux fois supérieur au seuil d’alerte. Toutefois, durant la semaine du 13 au 20 octobre, sa progression a été moins rapide que lors des deux semaines précédentes. Alors même que le dépistage a continué d’augmenter fortement dans le département.

Une évolution qui pourrait être un point plutôt positif si elle venait à se confirmer dans les semaines à venir.

Plus de 600 patients Covid-19 hospitalisés dans la Loire au 27 octobre

Le nombre d’hospitalisations est également élevé dans la Loire, où 609 patients Covid-19 étaient hospitalisés en simultané le 27 octobre, soit 150 de plus qu’une semaine auparavant. Depuis le 23 octobre, la Loire enregistre un nombre d’hospitalisations supérieur au niveau maximum atteint durant la « première vague ».

Le nombre de décès a désormais atteint le nombre de 383 et connaissait ces derniers jours une progression plus rapide encore que depuis le début de la deuxième vague en septembre.

74 patients Covid-19 étaient hospitalisés en réanimation dans la Loire au 27 octobre. Le chiffre augmente peu à peu depuis cet été, mais n’a pas encore atteint celui du 6 avril, le plus élevé constaté dans le département à ce jour (107). Leur nombre semble pour l’heure évoluer de façon moins rapide qu’au printemps dernier.

Les données utilisées

Les données hospitalières de l’épidémie de Covid-19

Elles proviennent des chiffres de Santé Publique France. Il s’agit de données journalières pour le nombre d’hospitalisations, de personnes en réanimation et de personnes décédées. Pour le taux d’incidence, il s’agit de données établies de façon hebdomadaire.

Précisions :

Pour le nombre de patients hospitalisés ou en réanimation ou en soins intensifs, il s’agit de données journalières non cumulées et provenant des hôpitaux (hors Ehpad donc). Les chiffres représentent donc le nombre de personnes hospitalisées ou en réanimations à ce jour.

Pour le nombre de personnes décédées à l’hôpital, les chiffres présentés sont un cumul depuis le début de la publication des données, à savoir le 18 mars. Voilà pourquoi les courbes des décès sont différentes des autres. Elles se stabilisent mais ne diminuent donc pas.

Limites des données hospitalières de Santé Publique France :

Le système de déclaration des cas n’est pas exhaustif et le nombre d’établissements déclarant varie au cours du temps ;
Certains patients, présents dans la base de données hospitalières à un moment donné, sont retirés de la base de données par les établissements de santé lorsque le résultat biologique du patient est négatif par rapport au COVID-19.

Le taux d’incidence de l’épidémie de Covid-19

Le taux d’incidence correspond au nombre de tests positifs pour 100.000 habitants. Il est calculé de la manière suivante : (100000 * nombre de cas positif) / Population.

Il est permis grâce au Système d’Informations de DEPistage (SI-DEP). Le nouveau système d’information de dépistage (SI-DEP), en déploiement depuis le 13 mai 2020, est une plateforme sécurisée où sont systématiquement enregistrés les résultats des laboratoires des tests (RT-PCR) réalisés par l’ensemble des laboratoires de ville et établissements hospitaliers concernant le SARS-COV2.

Précision :

Sélection de la première date avec pcr positive si plusieurs prélèvements positifs pour un même patient

Limites :

Seuls les tests biologiques des personnes pour lesquelles le département de résidence a pu être localisé sont représentés sur les cartes. Les personnes dont le département n’a pas pu être remonté dans les données SIDEP ne sont comptabilisées qu’au niveau France entière. De ce fait la somme des tests indiqués dans les départements ou régions est inférieure au nombre de tests indiqué en France.
Le délai de remontée des tests peut excéder 9 jours dans certains cas. Les indicateurs sont ajustés quotidiennement selon la réception des résultats.

Concernant le taux d’incidence, nous travaillons ici avec des données hebdomadaires. Ceci pour éviter les fluctuations quotidiennes parfois importantes. Cette échelle de temps permet de visualiser une évolution plus significative à nos yeux.

Les données de Santé Publique France concernant cet indicateur sont disponibles à partir du 13 mai 2020. Ceci explique que nos tableaux commencent au 19 mai, terme de la première semaine de 7 jours de statistiques.

Comme indiqué ci-dessus, le temps de remontée de ces données est plus long. De fait, ceci explique que pour notre point hebdomadaire nous n’ayons pas à disposition les données des tous derniers jours nous permettant d’effectuer un calcul du taux d’incidence hebdomadaire à date de la publication. Nous attendons que les données nous permettent de calculer cet indicateur de 7 jours en 7 jours à compter du 13 mai.

Le nombre de tests de dépistage Covid-19

Quels tests ?

Il s’agit de ceux enregistrés dans le système SI-DEP. Le nouveau système d’information de dépistage (SI-DEP), en déploiement depuis le 13 mai 2020, est une plateforme sécurisée où sont systématiquement enregistrés les résultats des laboratoires des tests (RT-PCR) réalisés par l’ensemble des laboratoires de ville et établissements hospitaliers concernant le SARS-COV2.

Précisions : Si plusieurs prélèvements sont rapportés pour un même patient:

Sélection de la première date pour les pcr ayant le même résultat (par exemple première date si plusieurs pcr négatives)
Si pcr discordantes chez un même patient (N et P), la première pcr positive est conservée.
Exclusion des résultats ininterprétables
A compter du 29/08, les indicateurs issus des données de laboratoires (SI-DEP) présentent des taux d’incidence, de positivité et de dépistage corrigés en fonction des dépistages réalisés dans les aéroports à l’arrivée des vols internationaux.

La correction s’applique sur l’ensemble des données postérieures à la date du 12 août.

Limites :

Seuls les tests biologiques des personnes pour lesquelles le département de résidence a pu être localisé sont représentés sur les cartes. Les personnes dont le département n’a pas pu être remonté dans les données SIDEP ne sont comptabilisées qu’au niveau France entière. De ce fait la somme des tests indiqués dans les départements ou régions est inférieure au nombre de tests indiqué en France.
Le délai de remontée des tests peut excéder 9 jours dans certains cas. Les indicateurs sont ajustés quotidiennement selon la réception des résultats.

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